临床检验科定级为国家重点（star=5）。科室为国家重点学科、国家临床重点专科、全军临床检验质控中心挂靠单位、江苏省重点实验室、江苏省医学重点学科，隶属于解放军临床检验医学研究所，前身为国民政府中央医院检验科、南京军区南京总医院检验科和全军临床医学检验中心，2013年入选国家临床重点专科，2014年通过CNAS的ISO15189医学实验室认可。
东部战区总医院临床检验科由临床生化和临床检验两个专业学科组成，下设急诊检验室、生化检验室、临床检验室和检验医学研究室。主院区检验科现有工作人员约35位，其中高级职称7人、博士4人、硕士7人；科室多人担任中国中西医结合学会检验专业委员会副主任委员、江苏省医学检验分会候任主任委员等学术职务，并为南京大学、南京医科大学等多所高校研究生培养点。
科室现开展常规检测项目约240余项，年医疗收入逾1.3亿元，始终坚持"姓军为兵、保障部队、服务官兵、军人优先"的卫勤宗旨，年完成干部体检和新兵体检工作量50余万件。2018年顺利通过ISO15189实验室认可监督评审，全国及江苏省常规检验室间质量评价成绩优秀。秦淮医疗区另设临床中心实验科（兼临床检测与科研），含5个常规检验室和3个研究室。
科室在检验质量与标准化方面处于区域引领地位，作为全军临床检验质控中心挂靠单位，承担区域内检验方法学比对与室间质评组织工作；科研方向涵盖检验新技术、分子诊断与精准医学，支撑医院肾脏病、肿瘤、感染等国家重点学科的转化研究，并为军队人员健康体检、新兵复检与卫勤保障提供高效精准的检验支撑。
- 通过ISO15189医学实验室认可，室内外质控成绩优秀
- 全军临床检验质控中心挂靠，区域检验质量标杆
- 临床免疫、微生物、分子遗传、基因诊断技术齐全
- 高端质谱与全自动流水线，检测通量大、速度快
- 为全院及军区提供精准检验与科研支撑
- 常规检验室间质量评价连续优秀，区域检验结果互认度高
- 临床生化与常规检验（肝肾功能、血糖血脂等）
- 临床免疫（自身抗体、肿瘤标志物、激素）
- 临床微生物（细菌培养与药敏、真菌感染）
- 分子遗传与基因诊断（含国家级临床基因诊断示范实验室）
- 艾滋病初筛、输血相关检测
- 全自动血液分析流水线、凝血分析流水线
- 高分辨质谱（Q Exactive）蛋白与代谢分析
- 分子遗传与基因诊断技术
- 临床免疫与自身抗体谱检测
- 微生物培养鉴定与药敏、血流感染快速检测
- 日本Sysmex XN、Sysmex HST全自动血液分析流水线
- 西门子Aptio Automation全自动凝血分析流水线、CS-5100血栓/止血分析仪
- 日立7600、奥林巴斯2700全自动生化分析仪、强生干式生化分析仪
- 美国ThermoFisher Q Exactive组合型四极杆静电场轨道质谱仪
- 美国贝克曼Optima L-90K超高速离心机
- 学科团队 含正高、副高多名，博士、硕士比例高，多人任江苏省医学检验分会候任主委、全军检验医学专业委员会委员等。
- 临床中心实验科 秦淮医疗区兼临床与科研，含5个常规检验室与3个研究室，正高5人、副高4人、博士7人。
① 挂号细分：检验科不对外单独挂号，由临床科室开单后至门诊检验窗口采样；急诊检验24小时。可通过"东部战区总医院"微信公众号预约临床科室号，放号时间以公众号为准（约早6:30起），自助机6:30开门；部分检验（如性激素、糖耐量）需特定时段，请遵医嘱。
② 院区区分：主院区（玄武区中山东路305号）设检验科门诊采样与急诊检验，地铁2号线/3号线大行宫站，公交至"南京军区南京总医院"站；秦淮医疗区设临床中心实验科。
③ 医保：常规检验费随门诊/住院按比例报销；南京市/江苏省医保直接结算；跨省异地就医需提前在国家医保服务平台备案；部分自费项目（如特殊基因测序）需知情同意。
④ 术前/检查前置准备：抽血生化多需空腹8—12小时（可少量饮水）；糖耐量、激素等有特殊时间要求；凝血/血栓项目前勿擅自停抗凝药（遵医嘱）；骨髓/穿刺由对应专科执行。
⑤ 住院：住院患者检验由病区护士采集；陪护按病区规定，探视时间以公告为准。
⑥ 急诊通道：危急值（如高钾、心梗标志物、重症感染）检验优先处理并即时回报，主院区急诊24小时。
⑦ 避坑指南：空腹项目上午完成更准；外院近期化验单如项目方法一致可作参考、避免重复抽血；特殊检验需提前预约，勿临时加做影响结果。
