妇科为国家临床重点专科，并先后获批国家卫生部妇科四级内镜培训基地、上海市妊娠糖尿病诊疗中心、上海市危重孕产妇抢救中心、上海交通大学医学院重点学科；2014年获卫生部妇科肿瘤临床诊治中心。学科是全国最早成立独立妇科肿瘤病区的学科之一，整体实力居国内前列。
妇产科由林元英教授创建，1951年林元英教授综合冈林氏和麦氏手术优点，使Ⅰ期病人术后四年以上生存率达95%。科室由妇科肿瘤、普通妇科、妇科内分泌与计划生育、母婴医学四个亚学科及相应病区组成。北院妇科核定床位60张、北院产科40张、北院日间病房17张，总计约117张；现有医技人员53人，其中教授12人、副教授16人，博士16人、硕士23人。年门诊约20万人次，年手术量8000余台，其中微创手术约3800台。曾获全国科学大会奖、全国医药卫生科学大会奖、上海市重大医学成果奖，卵巢癌早期诊断及预后判定研究获上海市科技进步一等奖，卵巢癌血管生成基础研究获教育部自然科学二等奖。
学科为中华医学会妇科肿瘤学会副主任委员单位、上海医学会妇科肿瘤学会主任委员单位、上海医学会妇产科学会副主任委员单位。在妇科恶性肿瘤（卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌）规范化诊疗、微创手术、单孔及机器人手术方面居区域领先；主持制定上海市妊娠糖尿病诊疗规范，是上海市妇科肿瘤规范化治疗多中心研究首席负责单位。2024年获上海市医疗新技术单孔腹腔镜技术，已开展机器人手术100余例；在国际上首次提出早期宫颈癌经腹根治性宫颈切除术中保留子宫动脉上行支的策略与技术。
常见病：子宫肌瘤、卵巢囊肿、月经失调、宫颈病变、HPV感染、盆底功能障碍。疑难重症：卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌、复杂性子宫内膜异位症、复发妇科恶性肿瘤。罕见病：罕见妇科肿瘤、生殖道畸形。合并并发症：妊娠合并妇科肿瘤、妇科恶性肿瘤合并内外科疾病等。
- 单孔腹腔镜与机器人微创手术（适配：子宫肌瘤、卵巢囊肿、早期妇科恶性肿瘤，兼顾生育力保护）
- 腹腔镜乙状结肠代阴道手术（适配：先天性无阴道、阴道闭锁等生殖道畸形）
- 保留子宫动脉上行支的早期宫颈癌根治性宫颈切除术（适配：有生育需求的早期宫颈癌）
- 妇科恶性肿瘤综合治疗与多学科诊疗（适配：卵巢癌、复发子宫内膜癌等疑难重症）
- 专科病房：北院妇科、产科及日间病房，总计约117张核定床位
- 国家卫生部妇科内镜培训中心，配套腹腔镜、宫腔镜等微创手术设备
- 妇产科研究室：国内规模较大的临床妇癌标本液氮储存库
- 依托医院3.0T磁共振、PET-CT、DSA等大型设备支撑疑难重症诊治
- 席晓薇 主任医师 教授：擅长子宫肌瘤、卵巢囊肿、卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌、异常子宫出血、宫颈病变及HPV感染诊治与手术；出诊院区：北部虹口院区 / 南部松江院区（以官网排班为准）
- 祝亚平 主任医师 教授：擅长子宫颈癌、卵巢癌、子宫癌、子宫肌瘤、卵巢囊肿、子宫内膜异位症、外阴白斑诊断及治疗；出诊院区：南北两院区（详见官网排班）
- 丰有吉 主任医师 教授：擅长妇科肿瘤诊断与治疗；出诊院区：详见官网出诊排班
- 桑震宇 主任医师：擅长妇科良恶性肿瘤诊治，对卵巢癌、子宫内膜癌、子宫颈癌的手术与化疗有较深造诣；出诊院区：详见官网排班
- 贺银燕 主任医师 博导：擅长妇科良恶性肿瘤微创手术（单孔、机器人）、盆底修复、免疫相关不孕；出诊院区：详见官网排班
院区区分：南北两院区均设妇科门诊与病房，复杂肿瘤与机器人手术多集中于北部虹口院区，就诊前请确认医生出诊院区
医保：上海市医保直接结算；异地就医请提前备案，部分自费耗材需知情同意
检查前置：宫腔镜、阴道镜需避开经期、术前禁性生活；需麻醉的宫腔镜手术术前禁食禁饮并遵医嘱停抗凝药；HPV与TCT检查前24小时避免阴道用药与冲洗
住院：择期手术需预约排队，部分良性病变可行日间手术；陪护与探视按院区病房管理规定执行
急诊通道：异常阴道出血、卵巢囊肿蒂扭转、异位妊娠破裂等急腹症走急诊绿色通道，24小时急救覆盖
避坑：勿以保健品替代规范随访；恶性肿瘤应到国家临床重点专科规范诊疗，避免重复检查与偏方延误
