国家临床重点专科（2012年3月遴选，河南省地市级医院中唯一国家临床重点专科）河南省烧伤整形中心（2008年省卫生厅命名）国家药物临床试验机构（GCP）

国家中医优势专科（骨伤科）河南省中医骨伤重点专科河南省中医药重点（培育）学科（骨伤科）国家中医（骨伤）区域医疗中心（中国中医科学院望京医院南阳医院）河南省区域中

国家中医优势专科（骨伤科）国家中医重点专科（骨伤方向）国家中医（骨伤）区域医疗中心（与中国中医科学院望京医院共建）河南省中医重点专科（骨伤科）河南省中医重点专科

国家中医重点专科国家中医优势专科建设单位（老年病方向）南阳市老年病中医诊疗重点科室

国家中医重点专科河南省区域中医儿科诊疗中心（2023 年通过验收）南阳市中西医结合儿童医院高惠然/王心东/赵青春全国名老中医药专家传承工作室国家中医住院医师规范化培训

国家临床重点专科建设单位（国家级重点临床学科）河南省临床医学重点（培育）学科（神经病学）国家高级卒中中心国家级卒中中心

河南省中医重点专科（中医肿瘤科）南阳中西医结合肿瘤医院（加挂牌子）

河南省中医重点专科（中医儿科）河南省中医重点学科（专科）带头人单位（张炜）张炜河南省名中医传承体系

河南省中医重点专科（中医脑病科）河南省中医管理局第二批中医重点专科（2007 年马锐教授带领创建）南阳市名中医（马锐）传承工作室

全国十佳肿瘤专科医院（2006年中国医院管理协会评选，评价类荣誉）

省级重点专科（来源：医院2025年助理全科医生培训招收简章，中医脊柱方向）

省级重点专科（来源：医院2025年助理全科医生培训招收简章）河南省烧伤整形中心（涵盖整形外科）

省级重点专科（来源：医院2025年助理全科医生培训招收简章）河南省重点培育学科住院医师规范化培训基地（康复方向）

省级重点专科（来源：医院2025年助理全科医生培训招收简章）国家高级卒中中心国家卫生健康委脑卒中筛查与防治基地中国医学科学院神经介入河南培训基地

河南省级重点专科（中医妇科）仲景苑中医特色专科

2024年度河南省临床重点学科（儿科）南阳市级重点专科（儿科）南阳市儿童医学中心

2024年度河南省临床重点学科（呼吸内科）南阳市级重点专科（呼吸内科）呼吸与危重症医学科（RICU）平台

2024年度河南省临床重点学科（神经内科）南阳市级重点专科（神经内科）国家高级卒中中心南阳市神经病学重点实验室

2024年度河南省临床重点学科（肿瘤科）国家药物临床试验机构（GCP）南阳市肿瘤过继免疫疗法重点实验室河南省肿瘤诊疗中心（区域协作）

河南省首批临床重点专科2024年度河南省临床重点学科心血管专业荣获“河南省区域医疗中心”称号国家胸痛中心（2017年通过国家认证）国家高级卒中中心/心衰中心/房颤中心/高