复旦全国第1国家重点学科国家临床重点专科全军烧伤研究所模范军事医学烧伤科

全国排名第2，西部第1

复旦全国第4国家临床重点专科全军临床病理学研究所院士领衔

全国第4，西部第1

国家级临床重点专科

复旦全国第7国家临床重点专科全军检验专科中心

2010年获“重庆市重点学科”；2011年获“国家级临床重点专科”。

复旦全国第8国家重点学科全军整形专科

复旦2023全国第9全军血液病中心国家血液系统疾病临床医学研究中心重庆分中心重庆市医学重点学科科技部国家级国际联合研究中心

复旦全国第10国家临床重点专科全军康复专病中心国际终身成就奖单位

复旦全国第10国家临床重点专科全军关节外科中心

复旦全国第10重庆市医学重点学科院优势专科

国家临床重点专科中国人民解放军口腔颌面外科中心重庆市口腔颌面外科医学重点学科全军临床重点专科西部口腔颌面头颈外科专科联盟理事长单位中央军委保健委员会会诊专家单位

国家级重点（培育）学科博士学位授权点学科·国家级眼科住培基地西南地区眼科创始学科（1950年）

国家临床重点专科(军建)全军肿瘤研究所复旦西南提名(2024)重庆市临床重点专科(2021)第二批军队临床重点专科(2024)国家级国际联合研究中心(2023)

国家重点学科重庆市美容外科质控中心国家卫健委整形美容外科质控中心委员单位

国家重点学科全军骨科中心全军腰椎退行性疾病微创治疗中心微创脊柱国内领先

国家重点学科全军神经外科中心全军癫痫诊治中心

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国家重点学科全军临床重点专科首批重庆市肺结节与早期肺癌专病诊疗中心