胰腺外科为国家临床重点专科（普通外科）、教育部重点学科，依托协和胰腺病研究所建设，是国内最早独立建制的胰腺疾病专科之一

肝胆外科为国家临床重点专科（普通外科）、教育部国家级重点学科

胃肠外科作为普通外科核心亚专科；依托国家临床重点专科、国家级重点学科（普通外科）

医院优势专科

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院级临床重点建设专科（胸心血管外科）

医院优势专科湖北省腹膜癌临床医学研究中心

医院优势专科武汉大学肝胆疾病研究院挂靠