复旦版中国医院专科声誉排行榜神经病学全国第 10 位；科室为浙江省唯一神经内科国家临床重点专科，被誉为 “浙江省神经科摇篮”；

复旦专科榜全国第 9｜国家临床重点专科｜浙江省重点学科

2019—2023 连续五年中国医院科技量值（STEM）消化病学全国第一；国家临床重点专科、浙江省医学重点学科

国家临床重点专科建设单位浙江省临床重点专科浙江省医学重点扶植学科8个亚专业13个病区医院优势专科

国家级中医重点专科浙江省中医药重点学科(中医骨伤科学)舟山市重点学科舟山市骨科创伤治疗中心医院优势专科

国家中医优势建设专科

国家中医重点专科

国家临床重点专科(在建)国家高级卒中中心中国胸痛中心(建设)医院优势专科

国家临床重点建设专科省市共建医学重点学科(肿瘤学)浙中区域专病中心

国家临床重点建设专科浙江省重点扶植学科省市共建医学重点学科浙中区域专病中心温州医科大学重点学科

国家中医优势专科建设项目省级中医药重点专科

国家级中医重点专科

国家中医优势专科（2024年入选）浙江省中医重点专科（针灸推拿科）衢州市首批重点建设品牌学科与特色专科杨继洲针灸国家级非遗传承与保护单位浙江省中医优势专科（针灸科）

国家临床重点专科建设项目衢州市医学重点学科衢州市医学支撑学科衢州市医学特色专科浙江-德国肺损伤修复与再生联合实验室呼吸内镜与肺结节精准诊治

国家中医重点专科2025年浙江省中医优势专科浙江省中医中风病医疗中心中国卒中学会卒中中心浙江省卒中防治中心微创颅内血管取栓与静脉溶栓

国家中医药管理局“十二五”重点专科国家农村医疗机构针灸理疗康复特色专科高压氧诊疗中心协同科室

国家中医重点专科2025年浙江省中医优势专科中国综合卒中中心联盟单位中国帕金森联盟成员单位浙江省脑血管病诊治中医药多学科交叉创新团队浙江省脑卒中医疗质量控制中心哨点

国家中医优势专科浙江省十三五中医药重点专科（康复科）浙江省中医优势专科联盟副组长单位金华市优先发展重点学科金华市医学重点学科重症康复等五大亚专科

国家中医药管理局重点建设专科国家中医药管理局十二五重点专科建设项目浙江中医药大学教学实习科室睡眠障碍专病门诊

国家临床重点专科（建设中）浙江省临床重点专科（建设中）浙江省区域专病中心建设学科省市共建医学重点学科非转移性结直肠癌临床创新团队（浙江省首批"小而强"）达芬奇手术